Illumina创始人创立的公司可能也许凉了
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各位亲爱的股东，大家早上好中午好晚上好！
今天，咱们聊聊蛋白测序。
朋友们，Encodia这家公司，还有印象吗？
老粉如果看过下面这篇文章，应该还有点残留记忆。
陷入绝境？NanoString第三次败给10x Genomics！至暗时刻还未到来
没错，Encodia就是哪家Illumina创始人之一Mark Chee创立的蛋白测序公司。
尴尬的是，正如上次提到他是NanoString陷入绝境，这次换成了Encodia。
据Geomeweb报道，援引前员工在Linkedin上发帖，在2025年底Encodia已经停止运营。
公司的资产还被放在网上拍卖，美国当地的朋友可以去看看能不能捡漏。
目前出价上看，Illumina NextSeq 2000测序仪还无人出价，底价2500美元。
甚至，不及一台NanoDrop One抢手...强烈建议Illumina自己拍回来，不然太丢人了...
不过，后来看到了600块的汉密尔顿移液工作站我也释怀了，蒜鸟蒜鸟...
呃，跑题了。
大概聊聊Encodia。
Encodia成立于2015年，公开的创始人为Julie Sunderland, Kevin Gunderson, Mark Chee, Michael Weiner四人。
其中，Mark Chee作为总裁和CEO无疑是核心人物。
Mark Chee我们很熟悉了，Illumina创始人之一。
但是，一个成功似乎并不一定能走向另外一个成功....
Anyway，我们看看Encodia的技术。
这是一家致力于对蛋白质进行大规模平行测序的公司，其原理并不难理解，拢共分3步。
看完，保证你马上能对着研发吼一通：这么简单的技术，咱们也整一个！（误）
第一步，切段。
将蛋白切成多肽肽段，将肽段连上一段DNA序列。
这段序列带有UMI分子标签和一段特定间隔序列（Sp），这序列是啥你别管，让研发头疼就行。
第二步，识别延伸。
用特定识别子识别肽段暴露出的氨基酸，这段识别子链接的序列与Sp序列结合并延伸。
然后，切掉这个暴露出的氨基酸，重复以上步骤。
你可以把这个过程理解成一个逆翻译的过程，是不是很简单？
识别子是什么你也别管，让研发头疼。
第三步，测序。
经过第二步，你已经得到了一堆包含UMI和对应肽段的DNA序列。
这叫啥？文库啊。
然后你把这个文库测序不就可以得到肽段的信息？是不是就可以拼出蛋白的信息？
很简单吧？让研发开发一个。
既然Encodia都干不下去了，这一套方法肯定有难以逾越的困难。
我们猜一猜几个可能性吧。
第一，识别子能够完整、准确识别20种氨基酸存疑。
第二，识别子是否能兼容PTM（翻译后修饰）检测，也存疑。
第三，蛋白到肽段的酶解效率、偏向性会不会存在问题呢？
另外，相对于友商Quantum-Si，Encodia迟迟没能推出商业化的产品。
而且Encodia也没有上市，在2021年拿到7500万美元C轮融资后在资本市场也没能再找到新的“活水”。
关门，也许就是早晚问题了。
顺带提一嘴，Encodia的A,B轮都没查到...
总之，利好Quantum-Si...
等等，Nautilus的产品终于要出来了么？从2023年等到2026年终于熬出头了？
各位感兴趣可以看看这篇：
蛋白组学公司Nautilus裁员+跳票
综合下来，说明一个问题：
要测蛋白比测DNA难多了。
不接受反驳，除非你能帮我搓一台蛋白测序仪。
Tags：#蛋白组学 #蛋白测序 #Illumina #测序 #Encodia #测序仪
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