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$Illumina(ILMN)$ $OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES PLC(ONT.UK)$ $10x Genomics, Inc.(TXG)$

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过去一年的四篇年度观察文章可以参见：

基序2023｜巨头浮沉的一年，测序市场动态调整开启

基序2023｜PacBio vs ONT，长读测序选购指南

基序2023｜你的WGS够囫囵（whole）吗？

基序2023｜步入100美元基因组的元年

这些文章里已经点出了测序行业正在发生的一些变化：新进入者带来的竞争、不断下降的利润空间、长读长测序技术不断成熟、基因检测的产品化提速、测序上下游的成本压力等等。

这些趋势还在持续演化，加载裹挟着行业内每家公司都需要密切关注的机会或挑战。

承接过往，新的一年行业可能会呈现怎样的动态，会有哪些看点？这篇是建设者的2024关注和期待。

新的测序仪还会层出不穷

• 2022年是推新大年，很多公司推出了Illumina NextSeq2000类似的中通量测序仪，2024年可能会有一波公司推出自己的NovaSeq-like高通量测序仪，这个名单可能包括Element、PacBio（去年收购了Apton）、赛陆、真迈等；

• Ultima在2023年又隐身了一年，接下来的JPM和AGBT都会参与，预计将正式开启商业化，UG100开放式测序框架会不会推动NHGRI那条经典的价格曲线在2024年穿破100美元基因组，值得期待；

• 其他公司可能会搞点不一样的：PacBio桌面式长读长测序仪？传闻MGI发新测序仪也有段时间了？终于能看到罗氏纳米孔测序仪的一些进展？

• 不管是否真高通量或代际，接下来一年国内估计会有四五个测序仪待发布？

• 如之前文章提到的，将看到更多的测序上游自动化提供商及品牌进入，甚至出现从样本到报告的测序诊断一体机？

多组学迎来喷薄发展

• 通过测序进行读出，空间组学和蛋白组学将迎来迅猛增长的一年；

• 高分辨率空间组学上的竞争将提速，预期10x Genomics将推出Visium HD进一步提升分辨率，其他的方法如stereo-seq，slide-seq等也将持续推进采用，其他国产的解决方案也都在迅速跟进；伴随着测序成本的下降，基于NGS的空间转录组学的发展可能会逐渐超过基于成像的方法？

• Illumina预期今年中期将推出与SomaLogic合作的7k蛋白组学产品，在一台测序仪上同时运行多个组学，这能否点燃整个蛋白组学的激情？当然，SomaLogic和Olink的最终委身/卖身命运都还没有敲定，SomaLogic的合并大概率会黄，但Olink还是将会依入Thermo怀抱。还能不能期待Olink的7k产品？

• 蛋白组学上也要看质谱如何扩容如何持续提升性能，这离不开上游分离富集策略的产品化推进。

专利互殴少不了了

• 激烈竞争的背后一定少不了专利官司；测序/MRD/单细胞/空间组/蛋白组等领域都已经狼烟四起；

• 单细胞/空间组领域的大玩家10x Genomics已经通过专利战把老对手NanoString打得快破产了；起诉其他几家Vizgen、Parse、Curio的官司也都在进行中；

• Olink起诉了即将商业化的新秀Alamar，这个判决结果对于PLA技术能否公开使用至关重要；SomaLogic也起诉了今年可能推出自己产品的Nautilus；

• MRD领域，natera似乎逐渐扳倒了ArcherDX/invitae和inviata/neogenomics，后面应该也不会闲着。

• 2024会看到更多的专利互殴。

生信分析的挑战越来越大大大

• 面对更多的数据集，更多的参考基因组，更多的数据类型，生信显然还没有完全跟上；

• T2T pangenome所需要的基准工作流程/管道的开发；

• 长读长测序带来的SV、甲基化等复杂变异类型的分析和解读；

• 空间组、蛋白组等多组学整合所带来的数据海啸；

• 这背后将需要更加的自动化分析管线的运行，以及更多AI/ML/GPT的加持；

• 期待看到更多队列/数据集/GWAS/MR所带来的新药靶点的发现和开发推进临床。

水面下可能暗流涌动

• 100美元基因组的较量开始；

• ONT全面进入Q30；

• 基因检测进入产品化时代，需要更多的证据和支撑，确定的参数性能，开始凸显品牌的作用；

• WGS是不是还会停留在30x这个标准，都已经Q40/50的准确率了？

• 低深度WGS可能会更多取代genotyping？

• 标准短读WGS叠加靶向长读panel会不会成为一个过渡形态？

• Instrument/microfluidics-free 的单细胞测序；

大公司今年可能要买买买了

• 丹纳赫、罗氏、赛默飞、布鲁克等在测序/多组学上会不会更多出手？

• 大胆猜测，10x Genomics会不会把Singular买了？Illumina会不会考虑入手空间组学公司，如Curio?

• Grail如果作为2024M&A最佳主角，一定会博取最大眼球，看看罗氏会不会出手？

IVD公司入局，卷到海外去

• IVD公司入局NGS能带来什么新鲜的视角？圣湘已经玩了一段时间了、安图推出自己的测序仪、几家IVD公司都通过投资进入了测序领域、今年可能看到其他还没有布局的IVD公司也要出手；

• MGI带头，国内测序制造商纷纷出海，一带一路、东南亚、中东欧、南北美非，要到处飞了。

• 林子大了有好多的鸟，看看国内哪家公司最先破了100元WGS测序的价格记录。

战略发展开始逐渐跳出固有的思考框架

• 对于大的测序平台来说，在诸如单细胞/空间组学这些方向上，究竟是要兼容别人的产品还是买个自己的产品？

• 如果同时有自己的产品，市场营销上如何平衡与别人的合作？

• 测序更多进入拆解时代，开发测序仪所积累的平台技术如何实现更多的价值，工程酶/修饰核苷酸/表面化学/原位扩增/微流体/光学/芯片设计等等树干还能嫁接什么枝插？

以上，只代表个人的推测和期待。

期待为您持续提供更多思考和观察的角度、非正式但试图客观的参考。